As pesquisas realizadas e/ou apoiadas pelo CECLIMAR, até o momento, abrangem inúmeros projetos integrados gerando produção intelectual nas áreas de Biologia Marinha, Limnologia, Geologia, e Geografia. Os Cursos de Pós-Graduação em Biologia Animal, Botânica, Ecologia, Genética e Geologia da UFRGS estão entre os que mais solicitam apoio logístico do Centro para a realização de suas pesquisas no Litoral Norte do Rio Grande do Sul. Ate o presente, esta cooperação redundou em aproximadamente em 36 dissertações e teses concluídas e mais de 50 publicações em revistas especializadas, além de vários relatórios e comunicações em Simpósios e Congressos nacionais e internacionais, representando um conjunto de informações valiosas, para o desenvolvimento da região. 

Em colaboração com a ONG Grupo de Estudo de Mamíferos  Aquáticos do Rio Grande do Sul - GEMARS vem sendo desenvolvido desde 1992, o projeto CETUS que trata do estudo de mamíferos marinhos.

"A pesquisa desenvolvida na região contribui para o conhecimento do ecossistema e seus recursos naturais."